按照林大鑫的命令，水师学堂海军第一舰队的编制不变，拥有8艘排水量过万吨的铁甲战列舰飞熊号、飞虎号、飞鹰号、飞狼号、飞狐号、飞豹号、飞鹿号和飞狮号。飞熊号依然是第一舰队的旗舰，舰队指挥官为孙喜涛。 林大鑫把俘虏的意大利铁甲战列舰排水量15701吨的雷贝尔托号被改名为天熊号，俘虏的意大利铁甲战列舰排水量15520吨的卡里格纳诺王子号被改名为天虎号。 俘虏的意大利铁甲战列舰排水量15680吨的雷德利亚号改名为天鹰号，俘虏的意大利铁甲战列舰排水量11914吨的弗朗西斯科号改名为天狼号。 俘虏的意大利铁甲战列舰排水量12080吨的玛利亚皮亚号改名为天狐号，俘虏的日本联合舰队铁甲战列舰排水量12200吨的水凤号改名为天豹号。 林大鑫用天熊号、天虎号、天鹰号、天狼号、天狐号和天豹号这6艘铁甲战列舰组成新的第二舰队，天熊号为旗舰，原飞熊号舰长蒋晨被任命为第二舰队的指挥官。 14艘排水量超过万吨的铁甲战列舰，组成了水师学堂海军新的第一、第二2支战列舰的舰队。 原来的第二舰队改名为第三舰队，改造后排水量7473吨的三隈号改名为兴隆号，排水量7630吨的熊野号改名为兴业号，它们都可以算作大型装甲巡洋舰，划归了第三舰队。 2艘在吴港造船厂缴获排水量7900吨的大型装甲巡洋舰被命名为兴和号和兴盛号，也划归给了第三舰队，使得第三舰队拥有了排水量7000吨以上的13艘大型装甲巡洋舰。第三舰队的旗舰兴海号，指挥官依然是姜辉。 水师学堂海军的前三支舰队将会做为打击海上敌人的主要力量。 新成立水师学堂海军第四舰队，抽调旅顺守备舰队排水量4568吨的中型快速装甲巡洋舰安海号，排水量2950吨的防护巡洋舰立海号，排水量3180吨的快速防护巡洋舰月海号，排水量3600吨的快速防护巡洋舰星海号，排水量2800吨的快速防护巡洋舰日海号，排水量2800吨的快速防护巡洋舰辰海号。 加上吴港造船厂缴获的2艘排水量4200吨被命名为安民号和安定号的快速防护巡洋舰，一共8艘军舰，加上16艘鱼雷艇、10艘小炮艇组成第四舰队，旗舰为安海号，指挥官为原来的旅顺守备舰队指挥官于傅。第四舰队主要负责旅顺基地的防卫。 排水量6901吨的铁甲舰威海号，排水量7935吨的老式铁甲舰定海号和镇海号，加上16艘鱼雷艇，组成第五舰队。旗舰威海号，指挥官是原来第二舰队旗舰兴海号的舰长陈明。第五舰队主要负责和北洋水师本队一起守卫威海卫基地。 水师学堂海军的第一、第二、第三舰队，根据需要随时在旅顺基地和威海卫基地之间轮换，而且林大鑫还准备新建立一个海军基地，就是现在的鸭绿江省南浦港。 南浦港被当时日本驻朝鲜的占领军，利用清军战俘已经把这个港口建设完成了一部分，林大鑫准备继续建设这个优良的港口，把它做为一个军港，建立南浦基地给水师学堂海军使用。 随着水师学堂海军舰队的规模越来越大，旅顺基地和威海卫基地已经不够海军使用的了。 除了上面的5支舰队，水师学堂海军还有由刺刀号和尖刀号组成的潜艇分队。 然后林大鑫还给水师学堂内的定北军新兵训练营下达命令，让新兵训练营内完成新兵训练的定北军新兵，直接坐着运输船到东北四省去，补充在东北的几个定北军整编师的损失。 定北军的新兵训练营一直有各地的青年来报名参加定北军，而且林大鑫因为鸭绿江省的朝鲜族青年也踊跃报名参加定北军，林大鑫在朝鲜的平壤设立了一所临时的新兵训练营，所以现在林大鑫手下有许多Ｍ.Ｄｄ-ｎEng.ｃoｍ